Проект «Проблемы межцивилизационного взаимодействия» ориентирован на содействие межцивилизационному согласию в условиях глобализации.
Проект «Сбережение народов» нацелен на противодействие распространению алкоголизма и наркозависимости в России.
10 мая 2012 г., в «Союзе Писателей России» был представлен сборник фантастических рассказов «Беспощадная толерантность», опубликованный при поддержке Фонда «Взаимодействие цивилизаций». Авторы книги – популярные российские фантасты – показывают возможное будущее человечества, если оно откажется от сложившихся тысячелетиями морально-нравственных ценностей во имя искаженного представления о толерантности.
Фонд обеспечил публикацию следующих книг:
Искандар М. «Возрождение России: медведь превращается в тигра», М.: Институт востоковедения РАН; Фонд «Взаимодействие цивилизаций»., 2009.
Эмануилов Р.Я., Яшлавский А.Э., «Терроризм и экстремизм под флагом веры. Религия и политическое насилие: проблема соотношения»: Монография. Издательство «Наука». М., 2010 г.
Сикоев Р.Р., «Панисламизм: истоки и современность», Издательство «Аспект Пресс», М.,2010 г.
Кадыров Ш. «Тайны туркменской демографии», М.: Институт востоковедения РАН; Фонд «Взаимодействие цивилизаций». 2010.
«Хазары: миф и история: Сборник статей». М., 2010;